| 基本信息 |
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研究领域 |
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叶初阳, 男，副研究员 中国科学院自动化研究所 |
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脑白质神经束连接人脑的各个区域，使神经信号得以在不同的区域间通信，是人脑正常工作不可或缺的重要组成部分。弥散磁共振成像技术提供了一种非侵入式研究白质神经束的方法。它利用组织中水分子扩散的各向异性，获得神经纤维束的结构信息，如纤维走向和纤维微结构。基于弥散磁共振成像的神经纤维束的重建可以用于对脑疾病和脑发育的科学研究。但是目前弥散磁共振成像的处理和分析方法仍然存在很多局限。 本人的研究方向为弥散磁共振图像处理和分析方法的研究，及其在脑网络、脑疾病等神经科学问题中的应用，主要包括: 1.纤维方向估计、纤维追踪、脑连接计算方法 2.图像分割及脑区细分算法 3.组织微结构估计算法 4.机器学习/深度学习在弥散磁共振图像处理和分析中的应用 研究领域 医学图像的处理和分析方法的研究，尤其是机器学习/深度学习在这一领域的应用。主要包括磁共振图像（特别是弥散磁共振图像）的处理方法，及其在脑结构和功能研究中的应用。 |
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| 招生信息 | ||
| 招生方向为医学图像处理。希望学生有扎实的编程能力和数学基础。特别欢迎对脑科学有一定了解或对机器学习/深度学习有实际经验的学生。 | ||
| 教育背景 | ||
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2009.9-2014.12 约翰霍普金斯大学 电子与计算机工程系 博士 导师：Jerry Prince 2009.9-2011.12 约翰霍普金斯大学 电子与计算机工程系 硕士 2005.9-2009.7 北京大学 信息科学技术学院 理学学士 |
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| 工作经历 | ||
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2016.11-至今 中国科学院自动化研究所脑网络组研究中心：副研究员（硕士生导师，2017.1-至今） 2015.3-2016.10 中国科学院自动化研究所脑网络组研究中心：助理研究员 |
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| 专利与奖励 | ||
| 出版信息 | ||
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C. Ye, “Estimation of Tissue Microstructure Using a Deep Network
Inspired by a Sparse Reconstruction Framework”,Information Processing in
Medical Imaging (IPMI), 2017. C. Ye, J.L. Prince, "Probabilistic tractography using Lasso bootstrap", Medical Image Analysis 35, Pages 544–553, 2017. C. Ye, “Fiber orientation estimation using nonlocal and local information”, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), 2016. C. Ye, J. Zhuo, R.P. Gullapalli, J.L. Prince, "Estimation of fiber orientations using neighborhood information'', Medical Image Analysis 32, Pages 243–256, 2016. C. Ye, J.L. Prince, "A Bayesian approach to fiber orientation estimation guided by volumetric tract segmentation", Computerized Medical Imaging and Graphics 54, Pages 35{47, 2016. Z. Yang, C. Ye, J.A. Bogovic, A. Carass, B.M. Jedynak, S.H. Ying, J.L. Prince, "Automated cerebellar lobule segmentation with application to cerebellar structural analysis in cerebellar disease”, NeuroImage 127, Pages 435–444, 2016. C. Ye, Z. Yang, S.H. Ying, J.L. Prince, “Segmentation of the cerebellar peduncles using a random forest classifier and a multi-object geometric deformable model: Application to spinocerebellar ataxia type 6”, Neuroinformatics 13(3), Pages 367–381, July 2015. C. Ye, E. Murano, M. Stone, J.L. Prince, “A Bayesian approach to distinguishing interdigitated muscles in the tongue from limited diffusion magnetic resonance imaging”, Computerized Medical Imaging and Graphics 45, Pages 63–74, October 2015. N. Shiee, P.-L. Bazin, J.L. Cuzzocreo, C. Ye, B. Kishore, A. Carass, P.A. Calabresi, D.S. Reich, J.L. Prince, D.L. Pham. “Reconstruction of the human cerebral cortex robust to white matter lesions: Method and validation”, Human Brain Mapping, 35(7): Pages 3385–3401, July 2014. P.-L. Bazin, C. Ye, J.A. Bogovic, N. Shiee, D.S. Reich, J.L. Prince, D.L. Pham, “Direct segmentation of the major white matter tracts in diffusion tensor images”, NeuroImage, 58(2): Pages 458–468, September 2011. |
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| 科研活动 | ||
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科研项目： 国家自然科学基金青年项目，61601461，基于扩散磁共振成像的概率纤维追踪算法研究，2017/01-2019/12，16万元， 主持 学术活动： 期刊审稿人：NeuroImage、Frontiers in Neuroinformatics、International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery、PLOS ONE 2017年医学图像计算与计算机辅助介入国际会议（MICCAI）审稿人 2017年MICCAI ENIGMA Cerebellum workshop项目委员会成员 2014-2017年国际生物医学成像研讨会（ISBI）审稿人 |
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| 合作情况 | ||
